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mercoledì 11 dicembre 2024
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lunedì 22 febbraio 2016
Gluconeogenesi.
Per ripetere per
l'imminente esame di biochimica ho deciso di fare una serie di post
sugli argomenti trattati. Perdonate eventuali imprecisioni.
Gluconeogenesi.
Quando il glucosio
scarseggia può essere sintetizzato da precursori non saccaridici
(lattato, piruvato, glicerolo, alcuni amminoacidi) mediante la
gluconeogenesi, “sintesi di nuovo glucosio”. Tale processo
avviene nel fegato e poco nel rene ed è prevalentemente
citoplasmatico, tranne che per la prima reazione, che è
mitocondriale. Costa di dieci reazioni, sette delle quali sono in
comune con la glicolisi, ma non possiamo pensare alla gluconeogenesi
come a un processo contrario della glicolisi, sebbene le reazioni in
comune siano catalizzate dagli stessi enzimi. È piuttosto
dispendioso dal punto di vista energetico.
Reazione complessiva:
2C3H4O3+4ATP+2GTP+2NADH+2H++6H2O--->
C6H12O6+4ADP+2GDP+2NAD++6Pi.
I reazione (I deviazione
dalla glicolisi):
Reazione irreversibile,
mitocondriale, anaplerotica per rifornire il ciclo dell'acido citrico
di ossalacetato, catalizzata dalla piruvato carbossilasi, che
richiede biotina come coenzima.
Piruvato+CO2+ATP---->
Ossalacetato+ADP+Pi.
II reazione:
Reazione reversibile,
d'ora in poi saranno tutte reazioni citoplasmatiche, catalizzata
dalla fosfoenolpiruvato carbossichinasi, enzima appartenente alla
classe delle liasi.
Ossalacetato+GTP
<:::::::> Fosfoenolpiruvato+GDP+CO2.
III reazione:
Reazione reversibile,
catalizzata dall'enolasi, enzima appartenente alla classe delle
liasi.
Fosfoenolpiruvato
<:::::::> 2-fosfoglicerato.
IV reazione:
Reazione reversibile,
catalizzata dalla fosfoglicerato mutasi, un enzima appartenente alla
classe delle isomerasi.
2-fosfoglicerato
<:::::::> 3- fosfoglicerato.
V reazione:
Reazione reversibile,
catalizzata dall'ezima fosfoglicerato chinasi, appartenente alla
classe delle transferasi.
3- fosfoglicerato+ ATP
<:::::::> 1,3-bisfosfoglicerato+ ADP.
VI reazione:
Si tratta di una reazione
reversibile catalizzata dalla gliceraldeide 3-fosfato deidrogenasi,
enzima appartenente alla classe delle ossidoreduttasi, NADH dipendente.
1,3-bisfosfoglicerato+NADDH2
<:::::::> Gliceraldeide 3-fosfato+ NAD+.
VII reazione:
Reazione reversibile,
catalizzata dalla triosofosfatoisomerasi, enzima appartenente alla
classe delle isomerasi.
Gliceraldeide
3-fosfato<:::::::> Diidrossi acetone fosfato.
VIII reazione:
Reazione reversibile,
catalizzata dall'aldolasi, enzima appartenente alla classe delle
liasi.
Diidrossi acetone fosfato
<:::::::> Fruttosio 1,6-bisfosfato.
IX reazione (seconda
deviazione dalla glicolisi):
Reazione irreversibile,
catalizzata dalla fruttosio 1,6 bisfosfatasi, controllata
allostericamente dal citrato.
Fruttosio 1,6-bisfosfato
-----> Fruttosio 6-fosfato.
Il fruttosio 6-fosfato
viene convertito a glucosio 6-fosfato mediante fosfoglucoisomerasi.
X reazione (terza
deviazione dalla glicolisi):
Reazione irreversibile,
catalizzata dalla glucosio 6-fosfatasi.
Glucosio 6-fosfato ----->
Glucosio.
La regolazione della
gluconeogenesi è determinata principalmente dal livello di glucagone
in circolo e dalla disponibilità di substrati gluconeogenici.
giovedì 18 febbraio 2016
Glicolisi.
Per ripetere per l'imminente esame di
biochimica ho deciso di fare una serie di post sugli argomenti
trattati. Perdonate eventuali imprecisioni.
Glicolisi.
La glicolisi è una delle vie
metaboliche del glucosio, mediante la quale questo composto a sei
atomi di carbonio viene ossidato a due molecole di piruvato, composto
a tre atomi di carbonio. Si tratta di un processo anaerobico che
avviene nel citoplasma di tutte le cellule e consta di dieci
reazioni. Può essere divisa in due fasi: la prima comprende le prime
cinque reazioni e si tratta di una fase di investimento energetico,
in cui si consumano due molecole di ATP e il glucosio è scisso in
due molecole di gliceraldeide 3-fosfato, mentre la seconda è la fase
di recupero energetico in cui le molecole di gliceraldeide 3-fosfato
sono convertite in due molecole di piruvato e si formano 4 molecole
di ATP.
La reazione complessiva è:
C6H12O6+2Nad++2ADP+2Pi----->
2C3H4O3+2Nadh+2ATP+2H2O+2H+.
Fase di investimento:
I reazione:
Si tratta di una reazione
irreversibile, catalizzata dall'esochinasi, un enzima che catalizza
la fosforilazione di altri esosi, tra cui fruttosio e mannosio, che
ha un'elevata affinità per il glucosio. Glucosio+ ATP---->
Glucosio 6- fosfato+ ADP.
II reazione:
Reazione reversibile, catalizzata dalla
fosfoglucosioisomerasi, enzima appartenente alla classe delle
isomerasi.
Glucosio 6-fosfato <::::::::::>
Fruttosio 6-fosfato.
III reazione:
Reazione irreversibile, catalizzata
dalla fosfofruttochinasi 1, enzima appartenente alla classe delle
transferasi e che controlla allostericamente questa via metabolica. È
inibita da un'alta concentrazione di ATP mentre è attivata da una
scarsa concentrazione di ATP.
Fruttosio 6-fosfato +ATP ----> Fruttosio
1,6-bisfosfato+ ADP.
IV reazione:
Reazione reversibile, catalizzata
dall'aldolasi, enzima appartenente alla classe delle liasi.
Fruttosio 1,6 bisfosfato <::::::::::>
gliceraldeide 3-fosfato+ diidrossiacetone fosfato.
V reazione:
Reazione reversibile, catalizzata dalla
triosofosfatoisomerasi, enzima appartenente alla classe delle
isomerasi. Viene definita interconversione dei triosi fosfato.
Diidrossi acetone fosfato <::::::::::>
Gliceraldeide 3-fosfato.
Fine della fase di investimento. Un
esoso è stato: fosforilato, isomerizzato e scisso in due triosi
fosfati interconvertibili.
Fase di recupero:
VI reazione:
Si tratta di una reazione reversibile
catalizzata dalla gliceraldeide 3-fosfato deidrogenasi, enzima
appartenente alla classe delle ossidoreduttasi, NADH dipendente.
Gliceraldeide 3-fosfato+ Pi <::::::::>
1,3-bisfosfoglicerato.
VII reazione:
Reazione reversibile, catalizzata
dall'ezima fosfoglicerato chinasi, appartenente alla classe delle
transferasi. Si tratta della prima reazione in cui si produce ATP.
1,3-bisfosfoglicerato+ ADP <::::::::>
3-fosfoglicerato+ ATP.
VIII reazione:
Reazione reversibile, catalizzata dalla
fosfoglicerato mutasi, un enzima appartenente alla classe delle
isomerasi.
3- fosfoglicerato <:::::::> 2-
fosfoglicerato.
IX reazione:
Reazione reversibile, catalizzata
dall'enolasi, enzima appartenente alla classe delle liasi.
2-fosfoglicerato <::::::::>
fosfoenolpiruvato.
X reazione:
Reazione irreversibile, catalizzata
dalla piruvato chinasi, un enzima appartenente alla classe delle
liasi. È durante questa reazione che si produce la seconda molecola
di ATP.
Fosfoenolpiruvato+ADP ---->
Piruvato+ ATP.
Le molecole piruvato prodotte possono
essere ossidate ad Acetil CoA per entrare poi nel ciclo dell'acido
citrico, oppure essere fermentato, in condizioni di anaerobiosi, a
lattato durante un'intensa contrazione muscolare o negli eritrociti
oppure ad alcol nei lieviti.
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